DiseaseMeth数据库有什么用

小编给大家分享一下DiseaseMeth数据库有什么用，希望大家阅读完这篇文章之后都有所收获，下面让我们一起去探讨吧！

DNA甲基化作为表观遗传的一种标记，在生长发育和疾病发生过程中扮演着重要角色。随着大规模甲基化研究的进行，积累了大量疾病相关的甲基化数据，DiseaseMeth就是一个保存了人类疾病相关的甲基化信息的数据库。

官网地址如下

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/diseasemeth/

在DiseaseMeth数据库中，甲基化数据的类型包括两大类别

1. 芯片

   
   

   对于DNA甲基化芯片，除了27K和450K这两种常见的illuminaDNA甲基化芯片，还有其他定制的芯片，比如illumina GoldenGate Methylation Cancer Panel I。

   
   

2. NGS
   
   

   高通量测序主要就是包含WGBS和RRBS两种数据。

   
   

详细的信息如下：

Array-based主要包括了27K和450K，其中27K为8.6， 450K为9.3；NGS-based主要包括了WGBS和RRBS,WGBS为3.9，RRBS为4.3。

对于疾病，包含下列7种类型：

1. Cancer

2. Genetic Disorder

3. Metabolic Disorder

4. Autoimmune Disease

5. Neurolobical Disease

6. Imflammation

7. Others

   
   

其中Cancer类型的数据最多，详细信息如下：

利用这个数据库，我们可以根据疾病或者基因检索相关信息。以基因DEFB119为例，该基因相关疾病的检索结果如下

从检索结果中，我们可以得到该基因相关的疾病，以及在该疾病中，这个基因的甲基化水平是上升还是降低。

对于相关疾病，还有热图数据可以下载

通过这个数据库，我们可以检索已有的对于某种疾病或者某个基因甲基化的研究结果。

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