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R语言怎么实现超几何分布

发表于:2025-01-17 作者:千家信息网编辑
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千家信息网最后更新 2025年01月17日R语言怎么实现超几何分布

本篇内容主要讲解"R语言怎么实现超几何分布",感兴趣的朋友不妨来看看。本文介绍的方法操作简单快捷,实用性强。下面就让小编来带大家学习"R语言怎么实现超几何分布"吧!

超几何分布的R实现

超几何分布是统计学中的一种离散分布,它描述了由有限个物件中抽出n个物件,成功抽出指定种类的物件的个数。 也是生物信息学中常用的一种统计分布模型。我们在GO,KEGG的富集分析时就采用的是这个模型。 其数学表达式如下:

其中:

N: 总样本数

m: 总样本中"特定类别"的数量

n: 从总样本中随机抽取的数量

k: 抽取样本中属于"特定类别"的数量

但是我们做统计模型时,统计不是分布概率,而是累积概率,所以计算的p_value 值计算公式为:

对应的R代码实现为:

1-phyper(k-1,m, N-m, n,)

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