R语言中怎么用ggplot2包绘制柱状图
发表于:2025-02-07 作者:千家信息网编辑
千家信息网最后更新 2025年02月07日,这篇文章主要讲解了"R语言中怎么用ggplot2包绘制柱状图",文中的讲解内容简单清晰,易于学习与理解,下面请大家跟着小编的思路慢慢深入,一起来研究和学习"R语言中怎么用ggplot2包绘制柱状图"吧
千家信息网最后更新 2025年02月07日R语言中怎么用ggplot2包绘制柱状图
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ggplot2包绘制了展示基因在样本中表达量与数量的柱状图
使用方法:
Rscript lnc_exp.r -husage: lnc_exp.r [-h] -i exp_data [-l legend.position] [-o outdir] [-p prefix] [-H height] [-W width]lnc_exp_Histogram:https://www..com/article/1552optional arguments: -h, --help show this help message and exit -i exp_data, --exp_data exp_data input data file path[required] -l legend.position, --legend.position legend.position Sets the location of the legend[none,left,right,bottom,top,or two-element numeric vector][optional,default top] -o outdir, --outdir outdir output file directory[optional,default cwd] -p prefix, --prefix prefix out file name prefix[optional,default lncRNA] -H height, --height height the height of the heat map[optional,default 5] -W width, --width width the width of the heat map[optional,default 5]
参数说明:
-i 输入基因表达矩阵文件,建议输入标准化过后的表达数据
#ID | S0-1 | S0-2 | S0-3 | S12-1 | S12-2 | S12-3 | T0-1 | T0-2 |
XLOC_000173 | 0.249352 | 0.1533 | 0.499899 | 0.258562 | 0.174361 | 0.659209 | 0.647131 | 0.705749 |
XLOC_000195 | 0.0500286 | 0.029918 | 0 | 0.0674263 | 0 | 0 | 0.0682668 | 0.0121699 |
XLOC_000196 | 0.458015 | 0.938447 | 0.72592 | 0.28384 | 0.271833 | 0.316445 | 0.742948 | 0.744104 |
-l 指定图例的位置,可以设置成none,left,right,bottom,top,or two-element numeric vector
使用举例:
Rscript lnc_exp.r -i All_lnc_gene_fpkm.tsv -l top -p lnc_exp_Histogram
感谢各位的阅读,以上就是"R语言中怎么用ggplot2包绘制柱状图"的内容了,经过本文的学习后,相信大家对R语言中怎么用ggplot2包绘制柱状图这一问题有了更深刻的体会,具体使用情况还需要大家实践验证。这里是,小编将为大家推送更多相关知识点的文章,欢迎关注!
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