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如何下载miRNA的5p, 3p 表达量

发表于:2025-01-19 作者:千家信息网编辑
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千家信息网最后更新 2025年01月19日如何下载miRNA的5p, 3p 表达量

这篇文章主要介绍"如何下载miRNA的5p, 3p 表达量",在日常操作中,相信很多人在如何下载miRNA的5p, 3p 表达量问题上存在疑惑,小编查阅了各式资料,整理出简单好用的操作方法,希望对大家解答"如何下载miRNA的5p, 3p 表达量"的疑惑有所帮助!接下来,请跟着小编一起来学习吧!

参考如下的代码:

# 设置下载的参数project <- "TCGA-CHOL"data_category <- "Transcriptome Profiling"data_type <- "Isoform Expression Quantification"workflow_type <- "BCGSC miRNA Profiling"legacy <- FALSE# 查询可以下载的数据,有时候查询的API不稳定,需要多试几次query <- GDCquery(project = project,                  data.category = data_category,                  data.type = data_type,                   legacy = legacy)# 下载数据GDCdownload(query = query,method='client')

其关键是设置data_type 为"Isoform Expression Quantification", 这样就是不同isoform 的表达量。

到此,关于"如何下载miRNA的5p, 3p 表达量"的学习就结束了,希望能够解决大家的疑惑。理论与实践的搭配能更好的帮助大家学习,快去试试吧!若想继续学习更多相关知识,请继续关注网站,小编会继续努力为大家带来更多实用的文章!

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