千家信息网

R语言方差分解实例分析

发表于:2024-11-13 作者:千家信息网编辑
千家信息网最后更新 2024年11月13日,本文小编为大家详细介绍"R语言方差分解实例分析",内容详细,步骤清晰,细节处理妥当,希望这篇"R语言方差分解实例分析"文章能帮助大家解决疑惑,下面跟着小编的思路慢慢深入,一起来学习新知识吧。方差分解分
千家信息网最后更新 2024年11月13日R语言方差分解实例分析

本文小编为大家详细介绍"R语言方差分解实例分析",内容详细,步骤清晰,细节处理妥当,希望这篇"R语言方差分解实例分析"文章能帮助大家解决疑惑,下面跟着小编的思路慢慢深入,一起来学习新知识吧。

方差分解分析(Variance Partitioning Analysis)

确定最佳环境因子组合之后,进行分解分析,

#P+Hb+eGFRvpa <- varpart(otu, env['P'], env[c('Hb')],env[c('eGFR')],chisquare = FALSE)vpaplot(vpa, digits = 2, Xnames = c('P', 'Hb',"eGFR"), bg = c('blue', 'red',"orange"))

参数 chisquare = TRUE,执行 CCA 的变差分解;默认情况下 chisquare = FALSE,即执行 RDA 的变差分解

注:如果 varpart() 不支持 CCA,请更新 R 版本(如 R3.6 的 vegan)

分成两组(DOC 为一组,AP 和 AK为另一组)环境变量

cca_vp <- varpart(otu, env['DOC'], env[c('AP', 'AK')], chisquare = TRUE)

读到这里,这篇"R语言方差分解实例分析"文章已经介绍完毕,想要掌握这篇文章的知识点还需要大家自己动手实践使用过才能领会,如果想了解更多相关内容的文章,欢迎关注行业资讯频道。

0