如何使用fastp软件对fastq文件进行剪切
发表于:2024-09-30 作者:千家信息网编辑
千家信息网最后更新 2024年09月30日,这篇文章主要介绍如何使用fastp软件对fastq文件进行剪切,文中介绍的非常详细,具有一定的参考价值,感兴趣的小伙伴们一定要看完!使用fastp软件对fastq文件进行剪切fastp是一款较新的数据
千家信息网最后更新 2024年09月30日如何使用fastp软件对fastq文件进行剪切
这篇文章主要介绍如何使用fastp软件对fastq文件进行剪切,文中介绍的非常详细,具有一定的参考价值,感兴趣的小伙伴们一定要看完!
使用fastp软件对fastq文件进行剪切
fastp是一款较新的数据质控软件,可以对测序数据进行处理。这里介绍如何对fastq文件进行剪切。
其命令如下:
fastp --in1 data_yuanshi/Tres_2_1.clean.fq.gz --out1 Tres_2_1.clean.fq.gz --in2 data_yuanshi/Tres_2_2.clean.fq.gz --out2 Tres_2_2.clean.fq.gz --trim_front1 15 --trim_front2 15 --correction --thread 8
参数:
--in1 read1输入文件
--out1 read1剪切后输出文件
--in2 read2输入文件
--out2 read2剪切后输出文件
--trim_front1 对read1的头部剪切
--trim_front2 对read2的头部剪切
--trim_tail1 对read1的尾部剪切
--trim_tail2 对read2的尾部剪切
--thread 设置线程数
以上是"如何使用fastp软件对fastq文件进行剪切"这篇文章的所有内容,感谢各位的阅读!希望分享的内容对大家有帮助,更多相关知识,欢迎关注行业资讯频道!
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