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python里用来画基因结构的模块是怎样的

发表于：2024-09-23 作者：千家信息网编辑
千家信息网最后更新 2024年09月23日，python里用来画基因结构的模块是怎样的，相信很多没有经验的人对此束手无策，为此本文总结了问题出现的原因和解决方法，通过这篇文章希望你能解决这个问题。直接使用pip进行安装pip install d
千家信息网最后更新 2024年09月23日python里用来画基因结构的模块是怎样的

python里用来画基因结构的模块是怎样的，相信很多没有经验的人对此束手无策，为此本文总结了问题出现的原因和解决方法，通过这篇文章希望你能解决这个问题。


直接使用pip进行安装
pip install dna_features_viewer
image.png
image.png

可以提供gff 格式 或者 genbank 格式 注释文件，也可以手动输入 基因各个特征的位置

试着运行其中的一个例子
image.png
from dna_features_viewer import GraphicFeature, GraphicRecord
features=[
    GraphicFeature(start=0, end=20, strand=+1, color="#ffd700",
                   label="Small feature"),
    GraphicFeature(start=20, end=500, strand=+1, color="#ffcccc",
                   label="Gene 1 with a very long name"),
    GraphicFeature(start=400, end=700, strand=-1, color="#cffccc",
                   label="Gene 2"),
    GraphicFeature(start=600, end=900, strand=+1, color="#ccccff",
                   label="Gene 3")
]
record = GraphicRecord(sequence_length=1000, features=features)
record.plot(figure_width=5)

这里遇到的问题是如何将图片保存下来呢？

可视化展示还有其他更丰富的功能，有时间再来探索

小明的数据分析笔记本

主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记！

接下来是为了凑字数申请原创的一些内容

这个链接有许多关于python 做生物信息的内容，其中有一个简易版本的基因组浏览器，争取把代码实现一遍

http://dmnfarrell.github.io/


看完上述内容，你们掌握 python里用来画基因结构的模块是怎样的的方法了吗？如果还想学到更多技能或想了解更多相关内容，欢迎关注行业资讯频道，感谢各位的阅读！

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