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R语言怎么实现模拟表型数据

发表于:2024-10-02 作者:千家信息网编辑
千家信息网最后更新 2024年10月02日,这篇"R语言怎么实现模拟表型数据"文章的知识点大部分人都不太理解,所以小编给大家总结了以下内容,内容详细,步骤清晰,具有一定的借鉴价值,希望大家阅读完这篇文章能有所收获,下面我们一起来看看这篇"R语言
千家信息网最后更新 2024年10月02日R语言怎么实现模拟表型数据

这篇"R语言怎么实现模拟表型数据"文章的知识点大部分人都不太理解,所以小编给大家总结了以下内容,内容详细,步骤清晰,具有一定的借鉴价值,希望大家阅读完这篇文章能有所收获,下面我们一起来看看这篇"R语言怎么实现模拟表型数据"文章吧。

GWAS根据遗传率和QTL的数量产出模拟表型数据

#Read SoybeanGenotype data fileD<-read.big.matrix("GN.txt", type="char", sep="\t",head = TRUE)dim(D)D=D[,2:31261]D1=as.data.frame(as.matrix(D))D2=t(D1)QTL <-100*(1:20) #pick 20 QTLu <-rep(0,31620) #marker effectsu[QTL] <- 1g <-as.vector(crossprod(D2,u))h3 <- 0.6      #heritability y <- g +rnorm(346,mean=0,sd=sqrt((1-h3)/h3*var(g)))#Saving simulated filewrite.table(y,"H60Q20.txt", sep="\t")

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