r语言怎么进行单因素方差分析
发表于:2024-10-01 作者:千家信息网编辑
千家信息网最后更新 2024年10月01日,这篇文章主要介绍"r语言怎么进行单因素方差分析"的相关知识,小编通过实际案例向大家展示操作过程,操作方法简单快捷,实用性强,希望这篇"r语言怎么进行单因素方差分析"文章能帮助大家解决问题。1, 导入软
千家信息网最后更新 2024年10月01日r语言怎么进行单因素方差分析
这篇文章主要介绍"r语言怎么进行单因素方差分析"的相关知识,小编通过实际案例向大家展示操作过程,操作方法简单快捷,实用性强,希望这篇"r语言怎么进行单因素方差分析"文章能帮助大家解决问题。
1, 导入软件包和数据
library(agricolae)
data(sweetpotato)
2, 查看数据类型
可以看到, 数据为两列, 第一列为不同病毒的类型, 第二列为产量, 为了研究不同病毒感染对产量的影响.
> head(sweetpotato)
virus yield
1 cc 28.5
2 cc 21.7
3 cc 23.0
4 fc 14.9
5 fc 10.6
6 fc 13.1
3, 使用R语言建模
因素: virus
变量: yield
model<-aov(yield~virus, data=sweetpotato)
summary(model)
4, 方差分析结果:
可以看到不同病毒达到显著性水平.
> summary(model)
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
virus 3 1170.2 390.1 17.34 0.000733 ***
Residuals 8 179.9 22.5
---
Signif. codes:
0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
5, 多重比较:
这里多重比较采用LSD方法.
out <- LSD.test(model,"virus", p.adj="bonferroni")
out$groups
结果可以看到, oo, ff,cc之间不显著(都有a), oo,ff与fc之间显著(字母没有交集).
> out$groups
yield groups
oo 36.90000 a
ff 36.33333 a
cc 24.40000 ab
fc 12.86667 b
6, 多重比较作图
plot(out)
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因素
方差
语言
分析
不同
显著
数据
病毒
知识
之间
产量
方法
类型
结果
行业
实用
交集
内容
变量
字母
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